保存修理工事のメインとなったのが，瓦工事。
城郭を護るだけでなく，鬼瓦や鯱瓦（しゃちがわら）は装飾品としての価値も高い。
平成の保存修理では，7万5,000枚の瓦に番付けしてから外し，反りや歪み，割れなどを確認した。
その後，清掃・選別が行われ，奈良や姫路の瓦専門工場で不足・不良分の瓦1万6,000枚が新たに製作された。
鬼瓦や丸瓦，滴水瓦（てきすいがわら）などには，築城した城主池田家の揚羽蝶（あげはちょう）の家紋や官位を表す桐紋など様々なものがみられる
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職人の腕が光った鬼瓦作り。不良・不足分は，旧鬼瓦の製作工程と同種工法，同型で新たに製作された
瓦は，焼く前に適度な温度と湿度の環境のなかで，徐々に乾燥・収縮させる
大天守の最上部に設置された鯱瓦は，全部で4尾が製作され，出来上がりのよい2尾が採用された。型と寸法は，それぞれ貞享の鯱，昭和の鯱に倣った
屋根瓦の葺替え作業で使用された銅製の釘は，一本ずつ丁寧に作り上げられた
旧来の瓦下地の上に桟を敷き，瓦をすべて葺き直した
